国家一级保护植物

蕨类植物

水韭科　水韭属所有种

裸子植物

柏　科　巨柏　苏铁科　苏铁属所有种　银杏科　银杏　松　科　百山祖冷杉
梵净山冷杉　元宝山冷杉　资源冷杉（大院冷杉）　银杉　巧家五针松　长白松
红豆杉科　台湾穗花杉　云南穗花杉　红豆杉属所有种　杉　科　水松　水杉

被子植物

泽泻科　长喙毛茛泽泻　桦木科　普陀鹅耳枥　天目铁木　伯乐树科　伯乐树（种萼木）
卫矛科　膝柄木　使君子科　萼翅藤　菊　科　革苞菊　龙脑香科　东京龙脑香
狭叶坡垒　坡垒　多毛坡垒　望天树　茅膏菜科　貉藻　苦苣苔科　瑶山苣苔
单座苣苔　报春苣苔　辐花苣苔　禾本科　华山新麦草　金缕梅科　银缕梅
木兰科　长蕊木兰　地枫皮　单性木兰　落叶木莲　华盖木　峨眉拟单性木兰
防己科　藤枣　睡莲科　莼菜　蓝果树科　珙桐　光叶珙桐　云南蓝果树
金莲木科　合柱金莲木　毛茛科　独叶草　茜草科　异形玉叶金花　无患子科　掌叶木

国家二级保护植物

蕨类植物

观音座莲科　法斗观音座莲　二回原始观音座莲　亨利原始观音座莲　铁角蕨科　对开蕨
蹄盖蕨科　光叶蕨　乌毛蕨科　苏铁蕨　天星蕨科　天星蕨　桫椤科　桫椤科所有种
蚌壳蕨科　蚌壳蕨科（所有种）　鳞毛蕨科　单叶贯众　玉龙蕨　七指蕨科　七指蕨
水蕨科　水蕨属所有种　鹿角蕨科　鹿角蕨　水龙骨科　扇蕨　中国蕨科　中国蕨

裸子植物

三类杉科　贡山三类杉　蓖子三类杉　柏　科　翠柏　红桧　岷江柏木　福建柏　朝鲜崖柏
松　科　秦岭冷杉　台湾油杉　海南油杉　柔毛油杉　太白红杉　四川红杉　油麦吊云杉
大果青扦　兴凯赤松　大别山五针松　红松　华南五针松（广东松）　毛枝五针松　金钱松
黄杉属所有种　红豆杉科　白豆杉　榧属（所有种）　杉　科　台湾杉（秃杉）

被子植物

芒苞草科　芒苞草　槭树科　梓叶槭　羊角槭　云南金钱槭　泽泻科　浮叶慈菇
夹竹桃科　富宁藤　蛇根木　萝摩科　驼峰藤　桦木科　盐桦　金平桦　天台鹅耳枥
花蔺科　拟花蔺　忍冬科　七子花　石竹科　金铁锁　卫矛科　十齿花　永瓣藤
连香树科　连香树　使君子科　千果榄仁　菊　科　画笔菊　四数木科　四数木
龙脑香科　无翼坡垒（铁凌）　广西青梅　青皮（青梅）　胡颓子科　翅果油树
大戟科　东京桐　壳斗科　华南锥　台湾水青冈　三棱栎　瓣鳞花科　瓣鳞花
龙胆科　辐花　苦苣苔科　秦岭石蝴蝶　禾本科　酸竹　沙芦草　异颖草　短芒披碱草
无芒披碱草　毛披碱草　内蒙古大麦　药用野生稻　普通野生稻　四川狼尾草　三蕊草
拟高梁　箭叶大油芒　中华结缕草　小二仙草科　乌苏里狐尾藻　金缕梅科　山铜材
长柄双花木　半枫荷　四药门花　水鳖科　水菜花　唇形科　子宫草
樟　科　油丹　樟树（香樟）　普陀樟　油樟　卵叶桂　润楠　舟山新木姜子　闽楠　浙江楠
楠木　豆　科　线苞两型豆　黑黄檀（版纳黑檀）　降香（降香檀）　格木
山豆根（胡豆莲）　绒毛皂荚　野大豆　烟豆　短绒野大豆　花榈木（花梨木）　红豆树
缘毛红豆　紫檀（青龙木）　油楠（蚌壳树）　任豆（任木）　狸藻科　盾鳞狸藻
木兰科　鹅掌楸　大叶木兰　馨香玉兰　厚朴　凹叶厚朴　长喙厚朴　圆叶玉兰　西康玉兰
宝华玉兰　香木莲　大果木莲　毛果木莲　大叶木莲　厚叶木莲　石碌含笑　峨眉含笑
云南拟单性木兰　合果木　水青树　楝　科　粗枝崖摩　红椿　毛红椿
肉豆蔻科　海南风吹楠　滇南风吹楠　云南肉豆蔻　茨藻科　高雄茨藻　拟纤维茨藻
睡莲科　莲　贵州萍逢草　雪白睡莲　蓝果树科　喜树（旱莲木）　铁青树科　蒜头果
木犀科　水曲柳　棕榈科　董棕　小钩叶藤　龙棕　罂粟科　红花绿绒蒿
斜翼科　斜翼　川苔草科　川藻（石蔓）　蓼科　金荞麦　报春花科　羽叶点地梅
毛茛科　粉背叶人字果　马尾树科　马尾树　茜草科　绣球茜　香果树　丁茜
芸香科　黄檗（黄菠椤）　川黄檗（黄皮树）　杨柳科　钻天柳　无患子科　伞花木
山榄科　海南紫荆木　紫荆木　虎耳草科　黄山梅　蛛网萼　冰沼草科　冰沼草
玄参科　胡黄连　呆白菜（崖白菜）　茄　科　山茛菪　黑三棱科　北方黑三棱
梧桐科　广西火桐　丹霞梧桐　海南梧桐　蝴蝶树　平当树　景东翅子树　勐仑翅子树
安息香科　长果安息香　秤锤树　瑞香科　土沉香　椴树科　柄翅果　蚬木　滇桐
海南椴　紫椴　菱　科　野菱　榆　科　长序榆　榉树　伞形科　珊瑚菜（北沙参）
马鞭草科　海南石梓（苦梓）　姜　科　茴香砂仁　拟豆蔻　长果姜

蓝　藻

念珠藻科　发菜

真　菌

麦角菌科　虫草（冬虫夏草）　口蘑科（白蘑科）　松口蘑（松茸）